I) Думаю нет смысла придумывать велосипеды с воскрешением персонажей путём проведения опытов Орочимару над всеми подряд, начиная с Хаку и заканчивая Данзо.
Предлагаю играть в 3 сезона. С самого начала с сюжетом, близким к оригиналу. Никакой RL. Видел несколько уныло чуть менее чем полностью.
1 и 2 сезон постараемся пробежать быстро (год-полтора). Если мы собираемся взяться всерьёз, то это не врямя для форума. Уложимся.
3 сезон собственно, начнётся с текущего на тот момент места манги, с внесёнными извенениями по ходам сюжета.

1 сезон ясен. По Наруто. Заканчивается соответственно уходом Саске. По окончании делаем перерыв на переработку анкет, дополнение системы боёв и т.п., в конце концов просто как передышку.

2 сезон тоже ясен. По Наруто Шиппууден и до текущей на тот момент главы манги.  По окончании - аналогично; + критическая доработка системы боёв.

3-й сезон. Будет ли идти под дудку манги, дудку администрации, или "ты чё! Я тя щас замачу", т.е. пользователей?

II) Ответвления сюжета возможно необходимы для продвижения системы боёв. (см ниже)

III) Система боёв.
Думаю необходимо ввести параметры боя. Не как в сапёре - 50 секунд безрезультатно кликаешь, затем результативно дохнешь, а ввести систему повреждений и всё к ней, соответственно прилагающееся.
Дабы не было бурления говн дисбаланса в боях типа Хината - Гаара необходимо изначально, в 1-м сезоне ввести систему уровневой раскачки персонажей, и, кто знает, под госу-руководством быть может Хината и убьёт Пэйна в текущей аниме-арке.

IV) Персонажи соответсвенно живы чуть более чем все, на начало 1-го сезона.
Неканоны? =\\

V) Соответственно управляющий состав должен вести арку в нужном направлении дабы тот же забуза не ушёл в Рампэйдж! ©, убив Наруто+Саске+Сакура+Какаши+Татзуна с одного удара.
Управление боями ляжет на модераторский состав практически полностью. Нужна высокая оперативность, дабы не ждать целый день подсчёт hp, если оный будет введён.

I) Таки с какого момента ви пrедлагаете начинать?

III) Касательно системы боёв. Видеть ты видел. В игры играл? Да. В настольные игры играл? Да. Была игрушка карточная классная Astral Tournament. У нас даже в школе по ней "чемпионат на хате был". Всё элементарно просто. Популярность же просто поражает.
Не надо придумывать систему боёв ВоВ. Всего нескольких параметров достаточно.

Но в итоге, в купе с сюжетом (и его ответвлениями, что важно) можно изменить баланс сил, и изменить значительно. Это интересно? Думаю да.

То что Мадара>Наруто>Саске>Конохомару, который выносит Пэйна с одного удара>Пэйна>Конохомару и так всем ясно, и изъело моск до основания. Надо вносить коррективы.
Больше играешь - больше прокачиваешься - становишься более сильным. Опять же то что мы видели не нужно.

Больше свободы.